| 1. Round | 11/01/2025 | CF Monterrey [U23] | - | Puebla FC [U23] | 1:1 |  |
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| 2. Round | 17/01/2025 | Puebla FC [U23] | - | Atlético San Luis [U23] | 1:0 | |
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| 4. Round | 28/01/2025 | Puebla FC [U23] | - | Mazatlán FC [U23] | 3:0 | |
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| 5. Round | 02/02/2025 | Santos Laguna [U23] | - | Puebla FC [U23] | 0:0 | ||||
| 6. Round | 07/02/2025 | Puebla FC [U23] | - | CF América [U23] | 3:1 | |
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| 8. Round | 21/02/2025 | Puebla FC [U23] | - | Club Tijuana [U23] | 4:0 | |
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| 9. Round | 26/02/2025 | CF Pachuca [U23] | - | Puebla FC [U23] | 0:0 | ||||
| 10. Round | 02/03/2025 | Gallos Blancos [U23] | - | Puebla FC [U23] | 1:0 | ||||
| 11. Round | 07/03/2025 | Puebla FC [U23] | - | Pumas UNAM [U23] | 0:0 | ||||
| 12. Round | 14/03/2025 | Puebla FC [U23] | - | Deportivo Toluca [U23] | 1:1 | ||||
| 17. Round | 19/03/2025 | Puebla FC [U23] | - | Club Necaxa [U23] | 1:3 | ||||
| 13. Round | 28/03/2025 | FC Juárez [U23] | - | Puebla FC [U23] | 2:1 | ||||
| 14. Round | 04/04/2025 | Puebla FC [U23] | - | UANL Tigres [U23] | 1:2 | ||||
| 15. Round | 12/04/2025 | Club León [U23] | - | Puebla FC [U23] | 3:0 | ||||
| 16. Round | 15/04/2025 | Deportivo Guadalajara [U23] | - | Puebla FC [U23] | 1:1 |
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