| 6. Round | 14/04/2024 | Pärnu JK Vaprus | - | FC Flora | 1:3 | ||||
| 12. Round | 21/05/2024 | FC Flora | - | FC Kuressaare | 1:0 | ||||
| 23. Round | 25/09/2024 | JK Nõmme Kalju | - | FC Flora | 3:0 | ||||
| 30. Round | 29/09/2024 | FC Flora | - | Pärnu JK Vaprus | 3:0 | ||||
| 31. Round | 05/10/2024 | Nõmme United | - | FC Flora | 0:4 |
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