| 22. Round | 24/08/2003 | FK Rostov | - | Chernomorets Novorossisk | 0:2 | ||||
| 23. Round | 31/08/2003 | Spartak-Alania Vladikavkaz | - | Chernomorets Novorossisk | 1:0 | ||||
| 24. Round | 13/09/2003 | Chernomorets Novorossisk | - | Torpedo Metallurg Moskva | 1:2 | ||||
| 27. Round | 04/10/2003 | Zenit St. Petersburg | - | Chernomorets Novorossisk | 3:0 | ||||
| 28. Round | 19/10/2003 | Chernomorets Novorossisk | - | Torpedo Moskva | 2:4 |  |
|||
| 29. Round | 25/10/2003 | Uralan Elista | - | Chernomorets Novorossisk | 1:0 |
Moldova