| 17. Round | 23/02/2013 | Slovan Liberec | - | FK Baumit Jablonec | 1:0 | ||||
| 18. Round | 01/03/2013 | Vysočina Jihlava | - | Slovan Liberec | 0:0 | ||||
| 19. Round | 09/03/2013 | Slovan Liberec | - | Dynamo České Budějovice | 3:1 |  |
|||
| 20. Round | 16/03/2013 | Slavia Praha | - | Slovan Liberec | 3:1 |  |
|||
| 21. Round | 29/03/2013 | Slovan Liberec | - | Sigma Olomouc | 1:0 | ||||
| 22. Round | 06/04/2013 | Baník Ostrava | - | Slovan Liberec | 0:1 | ||||
| 23. Round | 13/04/2013 | Slovan Liberec | - | FC Hradec Králové | 1:0 | |
|||
| 24. Round | 20/04/2013 | Slovan Liberec | - | Zbrojovka Brno | 2:0 | ||||
| 25. Round | 28/04/2013 | FK Mladá Boleslav | - | Slovan Liberec | 2:3 | ||||
| 26. Round | 04/05/2013 | Slovan Liberec | - | AC Sparta Praha | 2:0 | |
|||
| 27. Round | 11/05/2013 | 1. FC Slovácko | - | Slovan Liberec | 0:3 | ||||
| 28. Round | 21/05/2013 | Slovan Liberec | - | FK Teplice | 3:1 | ||||
| 29. Round | 26/05/2013 | Viktoria Plzeň | - | Slovan Liberec | 1:2 | |
|||
| 30. Round | 01/06/2013 | Slovan Liberec | - | 1. FK Příbram | 1:1 |
Ukraine