| Group B | 21/08/2016 | Ayacucho FC | - | Alianza Lima | 1:1 | ||||
| Group B | 24/08/2016 | Universidad San Martín | - | Ayacucho FC | 1:1 | ||||
| Group B | 11/09/2016 | Ayacucho FC | - | Alianza Atlético | 5:2 | ||||
| Group B | 19/09/2016 | Comerciantes Unidos | - | Ayacucho FC | 3:1 | ||||
| Group B | 24/09/2016 | Ayacucho FC | - | Sport Huancayo | 0:1 |  |
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| Group B | 02/10/2016 | Universitario de Deportes | - | Ayacucho FC | 4:2 | ||||
| Group B | 15/10/2016 | Ayacucho FC | - | Universidad Técnica | 2:0 | ||||
| Group B | 22/10/2016 | Ayacucho FC | - | Universidad San Martín | 2:2 |  |
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| Group B | 29/10/2016 | Alianza Atlético | - | Ayacucho FC | 1:1 | ||||
| Group B | 01/11/2016 | Ayacucho FC | - | Comerciantes Unidos | 2:0 | ||||
| Group B | 13/11/2016 | Alianza Lima | - | Ayacucho FC | 0:1 | ||||
| Group B | 18/11/2016 | Sport Huancayo | - | Ayacucho FC | 0:0 | ||||
| Group B | 23/11/2016 | Ayacucho FC | - | Universitario de Deportes | 1:1 | ||||
| Group B | 27/11/2016 | Universidad Técnica | - | Ayacucho FC | 1:1 |
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