| 1. Round | 13/09/2020 | Atromitos | - | Volos NFC | 0:2 |  |
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| 3. Round | 27/09/2020 | OFI Heraklion | - | Atromitos | 2:2 |  |
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| 4. Round | 04/10/2020 | Atromitos | - | AEK Athen | 1:0 | ||||
| 5. Round | 17/10/2020 | Olympiakos Piraeus | - | Atromitos | 4:0 | ||||
| 6. Round | 26/10/2020 | Atromitos | - | Panetolikos | 2:0 | ||||
| 7. Round | 31/10/2020 | Atromitos | - | PAS Giannina | 0:2 | ||||
| 10. Round | 28/11/2020 | AE Lárissa | - | Atromitos | 0:0 | ||||
| 11. Round | 05/12/2020 | Atromitos | - | Aris Saloniki | 2:2 | |
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| 12. Round | 14/12/2020 | Asteras Tripolis | - | Atromitos | 2:0 |
Greece