| 1. Round | 15/09/2016 | Al Ahli Doha | - | Al Gharafa | 4:2 |  |
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| 3. Round | 15/10/2016 | Muaither SC | - | Al Gharafa | 1:2 | ||||
| 4. Round | 20/10/2016 | Al Shahaniya | - | Al Gharafa | 1:1 | ||||
| 5. Round | 29/10/2016 | Al Gharafa | - | Al Sadd | 3:3 | |
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| 6. Round | 03/11/2016 | Al Wakrah | - | Al Gharafa | 0:2 | ||||
| 7. Round | 19/11/2016 | Al Gharafa | - | Al Arabi | 4:2 | |
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| 8. Round | 24/11/2016 | Al Khor SC | - | Al Gharafa | 1:2 | ||||
| 9. Round | 03/12/2016 | Al Gharafa | - | Al Rayyan | 3:2 | ||||
| 10. Round | 07/12/2016 | Umm-Salal | - | Al Gharafa | 0:2 | ||||
| 11. Round | 11/12/2016 | Al Sailiya | - | Al Gharafa | 2:1 |
Sudan