| 5. Round | 01/08/2016 | Club Rubio Ñu | - | River Plate | 5:1 | ||||
| 6. Round | 06/08/2016 | Deportivo Capiatá | - | Club Rubio Ñu | 1:0 | ||||
| 11. Round | 17/09/2016 | Club Rubio Ñu | - | General Díaz | 0:2 | ||||
| 12. Round | 26/09/2016 | Club Rubio Ñu | - | Guaraní | 0:2 | ||||
| 13. Round | 02/10/2016 | Club Olimpia | - | Club Rubio Ñu | 3:1 | ||||
| 14. Round | 16/10/2016 | Club Rubio Ñu | - | Sportivo Luqueño | 0:0 | ||||
| 15. Round | 21/10/2016 | Club Rubio Ñu | - | General Caballero ZC | 0:1 | ||||
| 16. Round | 29/10/2016 | River Plate | - | Club Rubio Ñu | 0:2 | ||||
| 17. Round | 04/11/2016 | Club Rubio Ñu | - | Deportivo Capiatá | 0:1 | ||||
| 18. Round | 19/11/2016 | Cerro Porteño | - | Club Rubio Ñu | 1:0 | ||||
| 19. Round | 25/11/2016 | Club Rubio Ñu | - | Sol de América | 1:1 | ||||
| 20. Round | 03/12/2016 | Club Nacional | - | Club Rubio Ñu | 3:1 |
Paraguay