3. Round
08/06/2016 17:45 Navigatoriai Vilnius - FK Rotalis 1:3
11/06/2016 11:00 FA Dainava - FK Palanga 1:6
14:00 Sveikata Kybartai - FK Panevėžys 0:1
15:00 Lygis Kaunas - FK Trakai 0:2
15:00 FK Eurostandartas - ŠSPC Radviliškis 2:4 aet
15:30 Ateitis Vilnius - FK Atlantas 0:7
17:00 DFK Dainava - FC Džiugas 3:5
12/06/2016 10:00 FK Nevėžis - Utenis Utena 2:0
10:00 Lokomotyvas Radviliškis - FK Banga Gargždai 2:3
16:00 Kruša Vilnius - Svyturys Klaipeda 1:3
16:00 FK Jonava - FK Sūduva 0:1
16/06/2016 16:30 Babrungas Plungė - FK Šilutė 2:1
17:30 Adiada Šiauliai - Saulininkas Šiauliai 2:1
18/06/2016 14:00 Elektrėnų Versmė - Koralas Klaipėda 0:5
17:30 Kauno Žalgiris - FK Žalgiris 0:6
19/06/2016 16:00 FK Granitas Vilnius - FC Stumbras 0:2
Round of 16
29/06/2016 16:00 Koralas Klaipėda - FC Džiugas 0:1 aet
05/07/2016 16:30 Svyturys Klaipeda - Babrungas Plungė 2:1
18:00 Adiada Šiauliai - Lokomotyvas Radviliškis 4:5 pso
06/08/2016 12:00 FK Rotalis - FK Atlantas 0:4
16:00 FK Banga Gargždai - FK Nevėžis 1:2
16:00 FK Palanga - FK Žalgiris 0:4
17:00 FK Panevėžys - FC Stumbras 0:2
07/08/2016 17:30 FK Sūduva - FK Trakai 4:0
Quarter-finals
20/08/2016 10:00 Svyturys Klaipeda - FK Sūduva 1:10
13:00 FK Nevėžis - FC Stumbras 0:3
15:00 FC Džiugas - FK Atlantas 1:2
16:00 Lokomotyvas Radviliškis - FK Žalgiris 0:7
Semi-finals
10/09/2016 15:00 FC Stumbras - FK Sūduva 0:2
11/09/2016 17:00 FK Atlantas - FK Žalgiris 1:2
Final
25/09/2016 12:00 FK Sūduva - FK Žalgiris 0:2 (0:0)
LFF Taurė
LFF Taurė