| 1. Round | 15/08/2008 | Botafogo - RJ | - | Atlético Mineiro | 3:1 |  |
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| 1. Round | 28/08/2008 | Atlético Mineiro | - | Botafogo - RJ | 2:5 | ||||
| Round of 16 | 25/09/2008 | América de Cali | - | Botafogo - RJ | 1:0 | |
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| Round of 16 | 02/10/2008 | Botafogo - RJ | - | América de Cali | 3:1 | |
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| Quarter-finals | 22/10/2008 | Estudiantes | - | Botafogo - RJ | 2:0 | |
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| Quarter-finals | 05/11/2008 | Botafogo - RJ | - | Estudiantes | 2:2 |  |
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