| 19. Round | 08/02/2009 | Neuchâtel Xamax FC | - | FC Luzern | 3:3 | ||||
| 20. Round | 14/02/2009 | FC Aarau | - | Neuchâtel Xamax FC | 0:0 | ||||
| 21. Round | 22/02/2009 | Neuchâtel Xamax FC | - | FC Sion | 3:2 | ||||
| 22. Round | 01/03/2009 | AC Bellinzona | - | Neuchâtel Xamax FC | 2:0 | ||||
| 23. Round | 08/03/2009 | Neuchâtel Xamax FC | - | FC Vaduz | 3:1 | ||||
| 24. Round | 15/03/2009 | FC Zürich | - | Neuchâtel Xamax FC | 3:0 |  |
|||
| 25. Round | 22/03/2009 | Grasshopper Club Zürich | - | Neuchâtel Xamax FC | 1:1 | |
|||
| 26. Round | 05/04/2009 | Neuchâtel Xamax FC | - | BSC Young Boys | 2:3 | |
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| 27. Round | 09/04/2009 | FC Basel 1893 | - | Neuchâtel Xamax FC | 3:0 | ||||
| 28. Round | 19/04/2009 | Neuchâtel Xamax FC | - | FC Basel 1893 | 2:3 | ||||
| 29. Round | 23/04/2009 | BSC Young Boys | - | Neuchâtel Xamax FC | 0:0 | ||||
| 30. Round | 26/04/2009 | Neuchâtel Xamax FC | - | Grasshopper Club Zürich | 4:1 | ||||
| 31. Round | 03/05/2009 | Neuchâtel Xamax FC | - | FC Zürich | 0:1 | ||||
| 32. Round | 09/05/2009 | FC Vaduz | - | Neuchâtel Xamax FC | 2:4 | ||||
| 33. Round | 13/05/2009 | Neuchâtel Xamax FC | - | AC Bellinzona | 1:0 | ||||
| 34. Round | 16/05/2009 | FC Sion | - | Neuchâtel Xamax FC | 1:0 | ||||
| 35. Round | 24/05/2009 | Neuchâtel Xamax FC | - | FC Aarau | 3:1 |
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