| 4. Round | 21/02/2009 | Deportivo Cuenca | - | Liga de Portoviejo | 3:0 |  |
|||
| 14. Round | 09/05/2009 | Olmedo | - | Deportivo Cuenca | 3:2 | ||||
| 12. Round | 21/05/2009 | Deportivo Quito | - | Deportivo Cuenca | 2:0 | ||||
| 16. Round | 24/05/2009 | Técnico Universitario | - | Deportivo Cuenca | 2:1 | ||||
| 13. Round | 28/05/2009 | Deportivo Cuenca | - | Manta | 2:1 | ||||
| 17. Round | 31/05/2009 | LDU Quito | - | Deportivo Cuenca | 1:1 | ||||
| 18. Round | 14/06/2009 | Deportivo Cuenca | - | El Nacional | 1:0 | ||||
| 19. Round | 21/06/2009 | Liga de Portoviejo | - | Deportivo Cuenca | 2:2 | ||||
| 20. Round | 28/06/2009 | Deportivo Cuenca | - | Emelec | 0:1 | ||||
| 21. Round | 05/07/2009 | Macará | - | Deportivo Cuenca | 3:0 | ||||
| 22. Round | 12/07/2009 | Deportivo Cuenca | - | Espoli | 0:1 |  |
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