| 1. Round | 30/06/2016 | AEK Larnaca | - | SS Folgore/Falciano | 3:0 | ||||
| 1. Round | 07/07/2016 | SS Folgore/Falciano | - | AEK Larnaca | 1:3 |  |
|||
| 2. Round | 14/07/2016 | Cliftonville FC | - | AEK Larnaca | 2:3 | ||||
| 2. Round | 21/07/2016 | AEK Larnaca | - | Cliftonville FC | 2:0 | ||||
| 3. Round | 28/07/2016 | AEK Larnaca | - | Spartak Moskva | 1:1 | ||||
| 3. Round | 04/08/2016 | Spartak Moskva | - | AEK Larnaca | 0:1 | ||||
| Play-offs | 18/08/2016 | AEK Larnaca | - | Slovan Liberec | 0:1 | ||||
| Play-offs | 25/08/2016 | Slovan Liberec | - | AEK Larnaca | 3:0 |
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