| 8. Round | 25/10/2009 | Villarreal CF | - | Málaga CF | 2:1 | ||||
| 9. Round | 01/11/2009 | Villarreal CF | - | CD Tenerife | 5:0 | ||||
| 10. Round | 08/11/2009 | Sevilla FC | - | Villarreal CF | 3:2 | ||||
| 11. Round | 22/11/2009 | Villarreal CF | - | Real Valladolid | 3:1 | ||||
| 14. Round | 13/12/2009 | Atlético Madrid | - | Villarreal CF | 1:2 | ||||
| 16. Round | 02/01/2010 | FC Barcelona | - | Villarreal CF | 1:1 | ||||
| 20. Round | 31/01/2010 | Villarreal CF | - | CA Osasuna | 0:2 | ||||
| 24. Round | 28/02/2010 | Villarreal CF | - | Deportivo La Coruña | 1:0 | ||||
| 25. Round | 07/03/2010 | Espanyol Barcelona | - | Villarreal CF | 0:0 | ||||
| 26. Round | 14/03/2010 | Villarreal CF | - | Xerez CD | 2:0 |  |
|||
| 27. Round | 21/03/2010 | Málaga CF | - | Villarreal CF | 2:0 | ||||
| 34. Round | 25/04/2010 | Racing Santander | - | Villarreal CF | 1:2 | ||||
| 38. Round | 15/05/2010 | Real Zaragoza | - | Villarreal CF | 3:3 |
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