| 5. Round | 28/08/1999 | SK Hradec Králové | - | FC Petra Drnovice | 0:2 | ||||
| 11. Round | 24/10/1999 | SK Hradec Králové | - | Dynamo České Budějovice | 1:0 | ||||
| 13. Round | 07/11/1999 | SK Hradec Králové | - | CU Bohemians Praha | 1:2 | ||||
| 14. Round | 20/11/1999 | Baník Ostrava | - | SK Hradec Králové | 2:2 |  |
|||
| 15. Round | 28/11/1999 | SK Hradec Králové | - | FC Dukla Pribram | 1:1 | ||||
| 16. Round | 05/12/1999 | Slovan Liberec | - | SK Hradec Králové | 1:0 | |
|||
| 18. Round | 26/02/2000 | Slavia Praha | - | SK Hradec Králové | 3:0 |
Czech Republic