| 2. Round | 11/09/2016 | Boca Juniors | - | Belgrano de Córdoba | 3:0 | ||||
| 3. Round | 18/09/2016 | Godoy Cruz | - | Boca Juniors | 1:1 | ||||
| 4. Round | 25/09/2016 | Boca Juniors | - | Quilmes | 4:1 | ||||
| 5. Round | 03/10/2016 | Tigre | - | Boca Juniors | 1:1 | ||||
| 6. Round | 16/10/2016 | Boca Juniors | - | Sarmiento de Junín | 2:0 | ||||
| 7. Round | 24/10/2016 | Atlético Tucumán | - | Boca Juniors | 2:2 | ||||
| 9. Round | 06/11/2016 | Gimnasia de La Plata | - | Boca Juniors | 0:3 |  |
|||
| 10. Round | 20/11/2016 | Boca Juniors | - | Rosario Central | 1:1 | |
|||
| 11. Round | 27/11/2016 | San Lorenzo | - | Boca Juniors | 1:2 | ||||
| 17. Round | 26/03/2017 | San Martín de San Juan | - | Boca Juniors | 1:2 | ||||
| 19. Round | 10/04/2017 | Vélez Sarsfield | - | Boca Juniors | 1:3 | ||||
| 21. Round | 23/04/2017 | Atlético Rafaela | - | Boca Juniors | 0:0 | ||||
| 26. Round | 27/05/2017 | Huracán | - | Boca Juniors | 1:1 |
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