| Group D | 03/04/2024 | Botafogo - RJ | - | Atlético Junior | 1:3 |  |
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| Group D | 10/04/2024 | Atlético Junior | - | Universitario de Deportes | 1:1 | ||||
| Group D | 24/04/2024 | Atlético Junior | - | LDU Quito | 1:1 | ||||
| Group D | 08/05/2024 | Universitario de Deportes | - | Atlético Junior | 1:1 | ||||
| Group D | 14/05/2024 | LDU Quito | - | Atlético Junior | 0:1 | ||||
| Group D | 28/05/2024 | Atlético Junior | - | Botafogo - RJ | 0:0 |  |
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| Round of 16 | 14/08/2024 | Colo-Colo | - | Atlético Junior | 1:0 | |
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| Round of 16 | 21/08/2024 | Atlético Junior | - | Colo-Colo | 1:2 |
Colombia