| 1. Round | 14/10/2020 | LDU Quito | - | Deportivo Cuenca | 5:0 | ||||
| 2. Round | 20/10/2020 | Deportivo Cuenca | - | Liga de Portoviejo | 2:1 | ||||
| 5. Round | 06/11/2020 | Independiente del Valle | - | Deportivo Cuenca | 2:1 | ||||
| 6. Round | 10/11/2020 | Orense SC | - | Deportivo Cuenca | 1:1 |  |
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| 7. Round | 14/11/2020 | Deportivo Cuenca | - | Delfín SC | 2:1 | ||||
| 10. Round | 28/11/2020 | Técnico Universitario | - | Deportivo Cuenca | 1:1 | ||||
| 11. Round | 05/12/2020 | Deportivo Cuenca | - | Mushuc Runa | 1:0 | ||||
| 13. Round | 11/12/2020 | Olmedo | - | Deportivo Cuenca | 1:1 | ||||
| 15. Round | 19/12/2020 | Guayaquil City | - | Deportivo Cuenca | 2:1 |
Ecuador