| 5. Round | 02/09/2012 | Metalurg Skopje | - | FK Bregalnica Štip | 2:1 |  |
|||
| 7. Round | 23/09/2012 | FK Bregalnica Štip | - | FK Rabotnički | 2:0 | |
|||
| 12. Round | 31/10/2012 | FK Bregalnica Štip | - | FK Drita | 3:0 | |
|||
| 15. Round | 18/11/2012 | KF Shkëndija 79 | - | FK Bregalnica Štip | 0:3 | |
|||
| 18. Round | 08/12/2012 | FK Rabotnički | - | FK Bregalnica Štip | 3:1 | |
|||
| 31. Round | 19/05/2013 | FK Bregalnica Štip | - | KF Shkëndija 79 | 4:3 | |
North Macedonia