| 17. Round | 23/02/2013 | Baník Ostrava | - | Dynamo České Budějovice | 0:0 |  |
|||
| 18. Round | 01/03/2013 | Dynamo České Budějovice | - | AC Sparta Praha | 0:2 | ||||
| 19. Round | 09/03/2013 | Slovan Liberec | - | Dynamo České Budějovice | 3:1 |  |
|||
| 20. Round | 15/03/2013 | Dynamo České Budějovice | - | Zbrojovka Brno | 1:1 | ||||
| 21. Round | 29/03/2013 | FK Dukla Praha | - | Dynamo České Budějovice | 4:0 | ||||
| 22. Round | 05/04/2013 | Dynamo České Budějovice | - | 1. FK Příbram | 0:1 | |
|||
| 23. Round | 13/04/2013 | FK Teplice | - | Dynamo České Budějovice | 4:0 | ||||
| 24. Round | 19/04/2013 | Dynamo České Budějovice | - | FK Baumit Jablonec | 2:1 | |
|||
| 27. Round | 10/05/2013 | Dynamo České Budějovice | - | FC Hradec Králové | 1:0 | |
|||
| 28. Round | 22/05/2013 | Slavia Praha | - | Dynamo České Budějovice | 3:0 | ||||
| 29. Round | 26/05/2013 | Dynamo České Budějovice | - | Vysočina Jihlava | 2:1 | ||||
| 30. Round | 01/06/2013 | Sigma Olomouc | - | Dynamo České Budějovice | 1:0 |
Czech Republic