| 2. Round | 11/09/2011 | Asteras Tripolis | - | AO Kerkyra | 0:0 | ||||
| 3. Round | 17/09/2011 | AO Kerkyra | - | Panetolikos | 2:3 | ||||
| 6. Round | 15/10/2011 | AO Kerkyra | - | Atromitos | 2:2 | ||||
| 9. Round | 06/11/2011 | Skoda Xanthi | - | AO Kerkyra | 1:0 | ||||
| 10. Round | 19/11/2011 | AO Kerkyra | - | Ergotelis | 2:1 | ||||
| 11. Round | 26/11/2011 | PAOK Saloniki | - | AO Kerkyra | 0:0 |  |
|||
| 12. Round | 04/12/2011 | AEK Athen | - | AO Kerkyra | 1:0 | ||||
| 13. Round | 11/12/2011 | AO Kerkyra | - | Olympiakos Piraeus | 0:4 | ||||
| 14. Round | 18/12/2011 | OFI Heraklion | - | AO Kerkyra | 0:0 | ||||
| 8. Round | 07/03/2012 | AO Kerkyra | - | Levadiakos | 3:2 |
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