| 1. Round | 20/07/2024 | MFK Vyškov | - | 1. SK Prostějov | 0:0 |  |
|||
| 2. Round | 26/07/2024 | Vysočina Jihlava | - | MFK Vyškov | 1:1 | ||||
| 6. Round | 16/08/2024 | SFC Opava | - | MFK Vyškov | 1:0 | ||||
| 7. Round | 26/08/2024 | MFK Vyškov | - | Zbrojovka Brno | 1:0 | ||||
| 8. Round | 01/09/2024 | FK Varnsdorf | - | MFK Vyškov | 1:2 | ||||
| 10. Round | 21/09/2024 | AC Sparta Praha B | - | MFK Vyškov | 1:0 | ||||
| 9. Round | 02/10/2024 | MFK Vyškov | - | MFK Chrudim | 0:3 | ||||
| 12. Round | 06/10/2024 | MFK Vyškov | - | Sigma Olomouc B | 1:0 | ||||
| 13. Round | 19/10/2024 | SK Líšeň | - | MFK Vyškov | 0:2 | ||||
| 14. Round | 26/10/2024 | MFK Vyškov | - | FC Zlín | 1:1 | ||||
| 15. Round | 03/11/2024 | Viktoria Žižkov | - | MFK Vyškov | 0:3 | ||||
| 16. Round | 10/11/2024 | MFK Vyškov | - | Vysočina Jihlava | 1:1 | |
|||
| 18. Round | 08/03/2025 | MFK Vyškov | - | Baník Ostrava B | 1:3 | ||||
| 19. Round | 16/03/2025 | Slavia Praha B | - | MFK Vyškov | 0:0 | ||||
| 20. Round | 29/03/2025 | MFK Vyškov | - | SFC Opava | 2:0 | ||||
| 17. Round | 01/04/2025 | FC Sellier & Bellot Vlašim | - | MFK Vyškov | 0:0 | ||||
| 21. Round | 05/04/2025 | Zbrojovka Brno | - | MFK Vyškov | 1:2 | ||||
| 22. Round | 12/04/2025 | MFK Vyškov | - | FK Varnsdorf | 2:2 | ||||
| 30. Round | 25/05/2025 | 1. SK Prostějov | - | MFK Vyškov | 0:2 |
Czech Republic