| 1. Round | 15/02/2025 | Yokohama F. Marinos | - | Albirex Niigata | 1:1 | ||||
| 3. Round | 26/02/2025 | Yokohama F. Marinos | - | Yokohama FC | 0:0 | ||||
| 4. Round | 01/03/2025 | Yokohama F. Marinos | - | Shonan Bellmare | 1:1 | ||||
| 6. Round | 16/03/2025 | Yokohama F. Marinos | - | Gamba Osaka | 2:0 | ||||
| 7. Round | 29/03/2025 | Fagiano Okayama | - | Yokohama F. Marinos | 1:0 | ||||
| 8. Round | 02/04/2025 | Nagoya Grampus | - | Yokohama F. Marinos | 2:0 | ||||
| 9. Round | 05/04/2025 | Yokohama F. Marinos | - | Tokyo Verdy | 0:0 | ||||
| 5. Round | 09/04/2025 | Kawasaki Frontale | - | Yokohama F. Marinos | 3:3 | ||||
| 10. Round | 12/04/2025 | Avispa Fukuoka | - | Yokohama F. Marinos | 2:1 | ||||
| 12. Round | 16/04/2025 | Yokohama F. Marinos | - | Shimizu S-Pulse | 2:3 | ||||
| 11. Round | 20/04/2025 | Urawa Red Diamonds | - | Yokohama F. Marinos | 3:1 | ||||
| 16. Round | 11/05/2025 | Cerezo Osaka | - | Yokohama F. Marinos | 1:0 | ||||
| 14. Round | 14/05/2025 | Yokohama F. Marinos | - | Kashiwa Reysol | 0:2 | ||||
| 17. Round | 17/05/2025 | Yokohama F. Marinos | - | Kyoto Sanga FC | 0:3 |
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