| 1. Round | 28/02/2021 | FC Ryūkyū | - | Júbilo Iwata | 1:0 | ||||
| 2. Round | 06/03/2021 | Júbilo Iwata | - | FC Machida Zelvia | 1:3 | ||||
| 3. Round | 13/03/2021 | Júbilo Iwata | - | Mito HollyHock | 3:2 | ||||
| 6. Round | 04/04/2021 | Fagiano Okayama | - | Júbilo Iwata | 0:1 | ||||
| 7. Round | 10/04/2021 | Júbilo Iwata | - | Matsumoto Yamaga | 4:1 | ||||
| 8. Round | 18/04/2021 | SC Sagamihara | - | Júbilo Iwata | 1:2 | ||||
| 9. Round | 21/04/2021 | Júbilo Iwata | - | RB Omiya Ardija | 3:2 | ||||
| 10. Round | 25/04/2021 | Montedio Yamagata | - | Júbilo Iwata | 1:0 | ||||
| 11. Round | 01/05/2021 | Júbilo Iwata | - | Tochigi SC | 3:2 | ||||
| 12. Round | 05/05/2021 | Ehime FC | - | Júbilo Iwata | 0:0 | ||||
| 15. Round | 23/05/2021 | Tokyo Verdy | - | Júbilo Iwata | 0:2 | ||||
| 16. Round | 29/05/2021 | Júbilo Iwata | - | Zweigen Kanazawa | 1:0 | ||||
| 17. Round | 05/06/2021 | Giravanz Kitakyushu | - | Júbilo Iwata | 0:2 | ||||
| 18. Round | 13/06/2021 | Júbilo Iwata | - | Ventforet Kofu | 1:0 | ||||
| 19. Round | 19/06/2021 | Júbilo Iwata | - | JEF United Chiba | 1:0 | ||||
| 21. Round | 03/07/2021 | Júbilo Iwata | - | Albirex Niigata | 3:2 |
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