| 1. Round | 06/08/2016 | SC Freamunde | - | União da Madeira | 0:1 | ||||
| 2. Round | 14/08/2016 | AD Fafe | - | SC Freamunde | 2:2 | ||||
| 3. Round | 20/08/2016 | SC Freamunde | - | Vitória Guimarães B | 0:1 | ||||
| 5. Round | 28/08/2016 | SC Freamunde | - | FC Porto B | 3:1 | ||||
| 4. Round | 03/09/2016 | CD Cova Piedade | - | SC Freamunde | 1:0 | ||||
| 6. Round | 10/09/2016 | FC Famalicão | - | SC Freamunde | 3:2 |  |
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| 7. Round | 17/09/2016 | SC Freamunde | - | SL Benfica B | 0:0 | ||||
| 8. Round | 21/09/2016 | Gil Vicente | - | SC Freamunde | 0:0 | ||||
| 10. Round | 02/10/2016 | Varzim SC | - | SC Freamunde | 0:0 | ||||
| 9. Round | 08/10/2016 | SC Freamunde | - | Académico de Viseu | 1:1 | ||||
| 11. Round | 19/10/2016 | SC Freamunde | - | Sporting CP B | 2:3 | ||||
| 13. Round | 29/10/2016 | SC Freamunde | - | Sporting Braga B | 0:0 |
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