| 1. Round | 02/08/1998 | SFC Opava | - | FC Boby-sport Brno | 2:1 | ||||
| 2. Round | 09/08/1998 | Viktoria Žižkov | - | SFC Opava | 3:2 | ||||
| 3. Round | 23/08/1998 | SFC Opava | - | FK Jablonec 97 | 2:1 | ||||
| 4. Round | 30/08/1998 | AC Sparta Praha | - | SFC Opava | 4:2 | ||||
| 5. Round | 13/09/1998 | SFC Opava | - | SK Hradec Králové | 3:1 | ||||
| 6. Round | 19/09/1998 | Viktoria Plzeň | - | SFC Opava | 1:1 |  |
|||
| 7. Round | 27/09/1998 | SFC Opava | - | FC Karviná | 2:1 | ||||
| 8. Round | 03/10/1998 | FC Petra Drnovice | - | SFC Opava | 3:2 | ||||
| 9. Round | 18/10/1998 | SFC Opava | - | Sigma Olomouc | 2:2 | ||||
| 10. Round | 25/10/1998 | SFC Opava | - | Slovan Liberec | 2:0 | ||||
| 12. Round | 07/11/1998 | SFC Opava | - | FK Teplice | 3:3 | ||||
| 13. Round | 15/11/1998 | Chmel Blsany | - | SFC Opava | 2:0 | ||||
| 15. Round | 28/11/1998 | Baník Ostrava | - | SFC Opava | 1:1 | ||||
| 19. Round | 14/03/1999 | SFC Opava | - | AC Sparta Praha | 2:1 | ||||
| 20. Round | 20/03/1999 | SK Hradec Králové | - | SFC Opava | 1:0 | ||||
| 21. Round | 04/04/1999 | SFC Opava | - | Viktoria Plzeň | 1:1 |  |
|||
| 22. Round | 11/04/1999 | FC Karviná | - | SFC Opava | 2:1 |
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