| 1. Round | 20/07/2024 | FK Jablonec | - | FK Mladá Boleslav | 2:0 | ||||
| 4. Round | 11/08/2024 | FK Mladá Boleslav | - | Dynamo České Budějovice | 4:0 |  |
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| 5. Round | 18/08/2024 | Sigma Olomouc | - | FK Mladá Boleslav | 3:2 | ||||
| 7. Round | 01/09/2024 | FK Teplice | - | FK Mladá Boleslav | 1:2 | ||||
| 9. Round | 22/09/2024 | FK Mladá Boleslav | - | FK Pardubice | 2:2 | ||||
| 11. Round | 06/10/2024 | FK Mladá Boleslav | - | Baník Ostrava | 0:0 | |
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| 14. Round | 02/11/2024 | FK Dukla Praha | - | FK Mladá Boleslav | 0:1 | ||||
| 15. Round | 10/11/2024 | FK Mladá Boleslav | - | AC Sparta Praha | 2:2 | |
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| 16. Round | 23/11/2024 | 1. FC Slovácko | - | FK Mladá Boleslav | 1:1 | ||||
| 17. Round | 01/12/2024 | FK Mladá Boleslav | - | FC Hradec Králové | 3:0 | |
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| 18. Round | 08/12/2024 | Dynamo České Budějovice | - | FK Mladá Boleslav | 0:4 |  |
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| 19. Round | 15/12/2024 | FK Mladá Boleslav | - | Sigma Olomouc | 1:3 |
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