| 10. Round | 29/10/2008 | Türkiyemspor Berlin | - | VfL Wolfsburg II | 2:1 | ||||
| 11. Round | 02/11/2008 | VfL Wolfsburg II | - | FC Oberneuland | 4:0 | ||||
| 18. Round | 25/02/2009 | VfL Wolfsburg II | - | Hertha BSC II | 1:2 | ||||
| 28. Round | 03/05/2009 | FC Oberneuland | - | VfL Wolfsburg II | 2:3 | ||||
| 29. Round | 08/05/2009 | VfL Wolfsburg II | - | Chemnitzer FC | 3:1 | ||||
| 30. Round | 13/05/2009 | Hannover 96 II | - | VfL Wolfsburg II | 1:2 |
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