| 17. Round | 10/03/2024 | RMSK Nový Bydžov [Youth C] | - | FK Mladá Boleslav [Youth C] | 1:1 | ||||
| 18. Round | 17/03/2024 | FK Mladá Boleslav [Youth C] | - | FK Ústí nad Labem [Youth C] | 3:6 | ||||
| 26. Round | 01/05/2024 | FK Pardubice [Youth C] | - | FK Mladá Boleslav [Youth C] | 2:1 | ||||
| 27. Round | 18/05/2024 | FK Mladá Boleslav [Youth C] | - | FC Hradec Králové [Youth C] | 1:2 | ||||
| 28. Round | 25/05/2024 | Slovan Liberec [Youth C] | - | FK Mladá Boleslav [Youth C] | 4:4 | ||||
| 29. Round | 05/06/2024 | FK Mladá Boleslav [Youth C] | - | Bohemians Praha 1905 [Youth C] | 4:3 | ||||
| 30. Round | 09/06/2024 | SK Kladno [Youth C] | - | FK Mladá Boleslav [Youth C] | 2:1 | ||||
| 16. Round | 15/06/2024 | FK Mladá Boleslav [Youth C] | - | FK Jablonec [Youth C] | 3:1 |
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