| 17. Round | 19/02/2000 | Dynamo České Budějovice | - | Viktoria Žižkov | 1:0 |  |
|||
| 18. Round | 27/02/2000 | SFC Opava | - | Dynamo České Budějovice | 3:2 |  |
|||
| 19. Round | 05/03/2000 | Dynamo České Budějovice | - | FK Jablonec 97 | 2:0 | ||||
| 20. Round | 10/03/2000 | FK Teplice | - | Dynamo České Budějovice | 3:0 | ||||
| 24. Round | 09/04/2000 | Dynamo České Budějovice | - | CU Bohemians Praha | 1:2 | |
|||
| 29. Round | 13/05/2000 | Slavia Praha | - | Dynamo České Budějovice | 4:1 |
Czech Republic