| 3. Round | 14/08/2006 | FK Marila Příbram | - | SK Kladno | 1:0 |  |
|||
| 4. Round | 19/08/2006 | AC Sparta Praha | - | FK Marila Příbram | 2:1 |  |
|||
| 5. Round | 27/08/2006 | FK Marila Příbram | - | FK Jablonec 97 | 0:1 | ||||
| 6. Round | 10/09/2006 | FK Marila Příbram | - | FK Mladá Boleslav | 1:2 | ||||
| 7. Round | 16/09/2006 | Tescoma Zlín | - | FK Marila Příbram | 1:0 | ||||
| 8. Round | 24/09/2006 | FK Marila Příbram | - | FK Teplice | 0:3 | ||||
| 9. Round | 30/09/2006 | Baník Ostrava | - | FK Marila Příbram | 1:1 | ||||
| 10. Round | 15/10/2006 | FK Marila Příbram | - | Slovan Liberec | 1:0 | |
|||
| 11. Round | 22/10/2006 | Dynamo České Budějovice | - | FK Marila Příbram | 2:1 | |
|||
| 12. Round | 29/10/2006 | FK Marila Příbram | - | Sigma Olomouc | 1:1 | |
|||
| 13. Round | 05/11/2006 | Slavia Praha | - | FK Marila Příbram | 1:1 | ||||
| 14. Round | 12/11/2006 | FK Marila Příbram | - | 1. FC Slovácko | 1:1 | ||||
| 15. Round | 19/11/2006 | 1. FC Brno | - | FK Marila Příbram | 2:0 | ||||
| 16. Round | 26/11/2006 | FK Marila Příbram | - | FK SIAD Most | 0:0 | ||||
| 17. Round | 03/12/2006 | Viktoria Plzeň | - | FK Marila Příbram | 2:0 | |
|||
| 19. Round | 18/03/2007 | FK Marila Příbram | - | AC Sparta Praha | 0:2 |
Czech Republic