| 1. Round | 05/02/2012 | Barcelona | - | Deportivo Cuenca | 3:1 | ||||
| 2. Round | 11/02/2012 | Deportivo Cuenca | - | Club Social y Deportivo Independiente José Terán | 3:2 | ||||
| 3. Round | 25/02/2012 | Macará | - | Deportivo Cuenca | 0:0 | ||||
| 5. Round | 04/03/2012 | Manta | - | Deportivo Cuenca | 0:0 | ||||
| 6. Round | 11/03/2012 | Deportivo Cuenca | - | Deportivo Quito | 1:4 | ||||
| 8. Round | 25/03/2012 | Deportivo Cuenca | - | Emelec | 0:3 | ||||
| 12. Round | 21/04/2012 | Liga de Loja | - | Deportivo Cuenca | 1:0 | ||||
| 13. Round | 29/04/2012 | Deportivo Cuenca | - | El Nacional | 1:0 | ||||
| 17. Round | 14/06/2012 | Deportivo Quito | - | Deportivo Cuenca | 1:3 | ||||
| 19. Round | 17/06/2012 | Olmedo | - | Deportivo Cuenca | 1:0 | ||||
| 20. Round | 24/06/2012 | Deportivo Cuenca | - | Macará | 0:2 |
Ecuador