| 5. Round | 08/09/2024 | Dynamo České Budějovice [Youth C] | - | FK Mladá Boleslav [Youth C] | 3:0 | ||||
| 2. Round | 11/09/2024 | FK Mladá Boleslav [Youth C] | - | FK Pardubice [Youth C] | 1:2 | ||||
| 7. Round | 21/09/2024 | Meteor Praha VIII [Youth C] | - | FK Mladá Boleslav [Youth C] | 1:4 | ||||
| 3. Round | 25/09/2024 | Viktoria Plzeň [Youth C] | - | FK Mladá Boleslav [Youth C] | 1:3 |  |
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| 8. Round | 29/09/2024 | FK Ústí nad Labem [Youth C] | - | FK Mladá Boleslav [Youth C] | 0:8 | |
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| 9. Round | 05/10/2024 | FK Mladá Boleslav [Youth C] | - | FK Příbram [Youth C] | 4:1 | |
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| 10. Round | 13/10/2024 | Slavia Praha [Youth C] | - | FK Mladá Boleslav [Youth C] | 4:3 | |
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| 11. Round | 19/10/2024 | FK Mladá Boleslav [Youth C] | - | FK Dukla Praha [Youth C] | 3:4 | |
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| 12. Round | 25/10/2024 | FC Hradec Králové [Youth C] | - | FK Mladá Boleslav [Youth C] | 2:2 | ||||
| 13. Round | 03/11/2024 | FK Mladá Boleslav [Youth C] | - | FK Teplice [Youth C] | 0:0 | ||||
| 14. Round | 09/11/2024 | Bohemians Praha 1905 [Youth C] | - | FK Mladá Boleslav [Youth C] | 2:5 | |
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| 15. Round | 17/11/2024 | FK Mladá Boleslav [Youth C] | - | SK Kladno [Youth C] | 2:0 | |
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