| 1. Round | 30/07/2016 | Red Star FC | - | AJ Auxerre | 0:0 | ||||
| 2. Round | 05/08/2016 | AJ Auxerre | - | Gazélec FC Ajaccio | 1:2 | ||||
| 3. Round | 12/08/2016 | FC Bourg-Péronnas | - | AJ Auxerre | 2:4 | ||||
| 4. Round | 19/08/2016 | AJ Auxerre | - | Clermont Foot 63 | 0:1 | ||||
| 5. Round | 26/08/2016 | US Orléans | - | AJ Auxerre | 0:0 | ||||
| 6. Round | 09/09/2016 | AJ Auxerre | - | FC Sochaux | 0:0 | ||||
| 7. Round | 17/09/2016 | Stade Brestois 29 | - | AJ Auxerre | 1:0 | ||||
| 10. Round | 30/09/2016 | Stade de Reims | - | AJ Auxerre | 3:0 | ||||
| 11. Round | 14/10/2016 | AJ Auxerre | - | Stade Lavallois | 2:0 | ||||
| 19. Round | 16/12/2016 | AJ Auxerre | - | Valenciennes FC | 1:1 | ||||
| 35. Round | 28/04/2017 | Nîmes Olympique | - | AJ Auxerre | 0:1 |
France
Senegal