| 1. Round | 21/08/1998 | Júbilo Iwata | - | Yokohama F. Marinos | 2:3 aet | ||||
| 2. Round | 28/08/1998 | Urawa Red Diamonds | - | Júbilo Iwata | 2:0 | ||||
| 5. Round | 14/09/1998 | Kyoto Purple Sanga | - | Júbilo Iwata | 2:3 | ||||
| 6. Round | 18/09/1998 | Júbilo Iwata | - | Verdy Kawasaki | 1:0 | ||||
| 7. Round | 22/09/1998 | Vissel Kobe | - | Júbilo Iwata | 0:7 | ||||
| 8. Round | 25/09/1998 | Júbilo Iwata | - | JEF United Ichihara | 6:2 |  |
|||
| 9. Round | 02/10/1998 | Yokohama Flügels | - | Júbilo Iwata | 0:4 | ||||
| 15. Round | 02/11/1998 | Kashima Antlers | - | Júbilo Iwata | 1:0 | ||||
| 16. Round | 06/11/1998 | Júbilo Iwata | - | Kashiwa Reysol | 4:0 | ||||
| 17. Round | 13/11/1998 | Gamba Osaka | - | Júbilo Iwata | 4:5 |
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