| 2. Round | 23/02/2025 | Oita Trinita | - | Iwaki FC | 0:0 | ||||
| 3. Round | 01/03/2025 | Vegalta Sendai | - | Oita Trinita | 2:0 | ||||
| 4. Round | 09/03/2025 | Oita Trinita | - | Mito HollyHock | 0:0 | ||||
| 5. Round | 16/03/2025 | Renofa Yamaguchi | - | Oita Trinita | 1:1 | ||||
| 6. Round | 23/03/2025 | Oita Trinita | - | Fujieda MyFC | 1:1 | ||||
| 7. Round | 30/03/2025 | Ehime FC | - | Oita Trinita | 0:1 | ||||
| 8. Round | 05/04/2025 | RB Omiya Ardija | - | Oita Trinita | 2:2 | ||||
| 9. Round | 13/04/2025 | Oita Trinita | - | Tokushima Vortis | 1:1 |  |
|||
| 10. Round | 20/04/2025 | JEF United Chiba | - | Oita Trinita | 1:0 | ||||
| 11. Round | 25/04/2025 | Júbilo Iwata | - | Oita Trinita | 0:3 |  |
|||
| 12. Round | 29/04/2025 | Oita Trinita | - | Sagan Tosu | 1:0 | |
|||
| 13. Round | 03/05/2025 | Oita Trinita | - | Roasso Kumamoto | 1:0 | ||||
| 14. Round | 06/05/2025 | Montedio Yamagata | - | Oita Trinita | 3:0 | ||||
| 15. Round | 11/05/2025 | Kataller Toyama | - | Oita Trinita | 1:1 | ||||
| 16. Round | 18/05/2025 | Oita Trinita | - | V-Varen Nagasaki | 1:2 | ||||
| 18. Round | 31/05/2025 | Oita Trinita | - | Ventforet Kofu | 2:1 |
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