| 1. Round | 03/08/2024 | FC Rapperswil-Jona | - | FC Basel 1893 II | 5:2 | ||||
| 3. Round | 28/08/2024 | FC Rapperswil-Jona | - | SR Delémont | 3:0 | ||||
| 6. Round | 07/09/2024 | BSC Young Boys II | - | FC Rapperswil-Jona | 1:3 | ||||
| 11. Round | 12/10/2024 | FC Rapperswil-Jona | - | FC Biel/Bienne | 1:0 | ||||
| 14. Round | 26/10/2024 | FC Rapperswil-Jona | - | FC Luzern II | 3:3 |  |
|||
| 15. Round | 02/11/2024 | FC Grand-Saconnex | - | FC Rapperswil-Jona | 3:0 | ||||
| 16. Round | 09/11/2024 | FC Rapperswil-Jona | - | SC Cham | 1:2 | ||||
| 17. Round | 16/11/2024 | FC Bavois | - | FC Rapperswil-Jona | 0:1 |  |
|||
| 18. Round | 09/02/2025 | FC Basel 1893 II | - | FC Rapperswil-Jona | 0:3 | ||||
| 19. Round | 15/02/2025 | FC Rapperswil-Jona | - | FC Paradiso | 0:0 | ||||
| 21. Round | 01/03/2025 | FC Rapperswil-Jona | - | Vevey-Sports | 3:0 | ||||
| 22. Round | 08/03/2025 | FC Bulle | - | FC Rapperswil-Jona | 1:2 | |
|||
| 26. Round | 05/04/2025 | FC Breitenrain Bern | - | FC Rapperswil-Jona | 1:1 | ||||
| 30. Round | 26/04/2025 | SC Kriens | - | FC Rapperswil-Jona | 1:5 | ||||
| 32. Round | 10/05/2025 | FC Rapperswil-Jona | - | FC Grand-Saconnex | 4:2 | ||||
| 33. Round | 17/05/2025 | SC Cham | - | FC Rapperswil-Jona | 0:2 |
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