| 1. Round | 26/07/2015 | Slovan Liberec | - | FK Mladá Boleslav | 4:2 | ||||
| 2. Round | 02/08/2015 | FK Mladá Boleslav | - | Zbrojovka Brno | 2:0 | ||||
| 3. Round | 08/08/2015 | Baník Ostrava | - | FK Mladá Boleslav | 2:2 | ||||
| 4. Round | 14/08/2015 | FK Mladá Boleslav | - | AC Sparta Praha | 2:4 |  |
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| 5. Round | 21/08/2015 | FK Mladá Boleslav | - | FC Fastav Zlín | 5:2 | |
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| 6. Round | 12/09/2015 | Slavia Praha | - | FK Mladá Boleslav | 1:1 | ||||
| 7. Round | 19/09/2015 | FK Mladá Boleslav | - | FK Teplice | 4:3 | |
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| 8. Round | 25/09/2015 | FK Jablonec | - | FK Mladá Boleslav | 1:2 | ||||
| 9. Round | 03/10/2015 | FK Mladá Boleslav | - | 1. FK Příbram | 4:0 | |
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| 10. Round | 16/10/2015 | FK Dukla Praha | - | FK Mladá Boleslav | 1:1 | ||||
| 11. Round | 24/10/2015 | FK Mladá Boleslav | - | 1. FC Slovácko | 4:1 | ||||
| 12. Round | 31/10/2015 | Sigma Olomouc | - | FK Mladá Boleslav | 1:2 | ||||
| 13. Round | 07/11/2015 | FK Mladá Boleslav | - | Vysočina Jihlava | 6:1 | |
|||
| 14. Round | 21/11/2015 | Viktoria Plzeň | - | FK Mladá Boleslav | 1:0 | ||||
| 15. Round | 28/11/2015 | FK Mladá Boleslav | - | Bohemians Praha 1905 | 1:1 | |
 |
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| 16. Round | 06/12/2015 | Zbrojovka Brno | - | FK Mladá Boleslav | 1:1 |
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