| 1. Round | 23/08/2020 | Bohemians Praha 1905 | - | FK Mladá Boleslav | 4:0 | ||||
| 2. Round | 29/08/2020 | FK Mladá Boleslav | - | FC Fastav Zlín | 1:3 | ||||
| 3. Round | 13/09/2020 | Viktoria Plzeň | - | FK Mladá Boleslav | 2:1 | ||||
| 4. Round | 21/09/2020 | FK Mladá Boleslav | - | FK Jablonec | 2:0 |  |
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| 5. Round | 26/09/2020 | MFK Karviná | - | FK Mladá Boleslav | 0:0 | ||||
| 6. Round | 03/10/2020 | FK Mladá Boleslav | - | Dynamo České Budějovice | 2:2 | |
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| 7. Round | 08/11/2020 | Slavia Praha | - | FK Mladá Boleslav | 1:0 | ||||
| 8. Round | 21/11/2020 | FK Mladá Boleslav | - | FK Pardubice | 4:1 | ||||
| 9. Round | 28/11/2020 | 1. FK Příbram | - | FK Mladá Boleslav | 2:1 | ||||
| 10. Round | 06/12/2020 | FK Mladá Boleslav | - | FK Teplice | 0:2 | ||||
| 11. Round | 12/12/2020 | SFC Opava | - | FK Mladá Boleslav | 2:2 | ||||
| 12. Round | 15/12/2020 | FK Mladá Boleslav | - | Baník Ostrava | 1:3 | ||||
| 13. Round | 19/12/2020 | Slovan Liberec | - | FK Mladá Boleslav | 3:0 |
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