| Group E | 28/04/2024 | Brasiliense - DF | - | Anápolis FC - GO | 1:0 |  |
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| Group E | 11/05/2024 | Capital - TO | - | Anápolis FC - GO | 1:2 | ||||
| Group E | 19/05/2024 | CRAC - GO | - | Anápolis FC - GO | 1:2 | ||||
| Group E | 02/06/2024 | Real Brasilia - DF | - | Anápolis FC - GO | 0:1 | ||||
| Group E | 08/06/2024 | Anápolis FC - GO | - | União Rondonópolis - MT | 1:1 | ||||
| Group E | 12/06/2024 | União Rondonópolis - MT | - | Anápolis FC - GO | 1:0 | ||||
| Group E | 16/06/2024 | Anápolis FC - GO | - | Real Brasilia - DF | 1:0 | ||||
| Group E | 29/06/2024 | Anápolis FC - GO | - | CRAC - GO | 0:0 | |
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| Group E | 07/07/2024 | Anápolis FC - GO | - | Capital - TO | 3:1 |  |
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| Group E | 20/07/2024 | Anápolis FC - GO | - | Brasiliense - DF | 0:2 | ||||
| Round of 32 | 28/07/2024 | Itabuna - BA | - | Anápolis FC - GO | 1:0 | ||||
| Quarter-finals | 31/08/2024 | Iguatu - CE | - | Anápolis FC - GO | 4:5 pso | |
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| Semi-finals | 08/09/2024 | Anápolis FC - GO | - | Maringá - PR | 1:1 |
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