| 1. Round | 28/08/1998 | Valencia CF | - | Atlético Madrid | 1:0 | ||||
| 2. Round | 11/09/1998 | Atlético Madrid | - | UD Salamanca | 2:0 | ||||
| 3. Round | 19/09/1998 | Espanyol Barcelona | - | Atlético Madrid | 1:1 | ||||
| 4. Round | 25/09/1998 | Atlético Madrid | - | Real Sociedad | 4:1 | ||||
| 5. Round | 03/10/1998 | Real Oviedo | - | Atlético Madrid | 3:1 |  |
|||
| 8. Round | 30/10/1998 | Atlético Madrid | - | CD Alavés | 3:0 | ||||
| 9. Round | 07/11/1998 | Atlético Madrid | - | Deportivo La Coruña | 1:1 | ||||
| 10. Round | 14/11/1998 | Villarreal CF | - | Atlético Madrid | 2:1 | ||||
| 11. Round | 20/11/1998 | Atlético Madrid | - | Real Valladolid | 6:1 | ||||
| 14. Round | 11/12/1998 | Real Betis | - | Atlético Madrid | 0:0 | ||||
| 16. Round | 02/01/1999 | Racing Santander | - | Atlético Madrid | 2:3 | ||||
| 36. Round | 29/05/1999 | CF Extremadura | - | Atlético Madrid | 2:1 | ||||
| 37. Round | 11/06/1999 | Atlético Madrid | - | Real Madrid | 3:1 | |
|||
| 38. Round | 19/06/1999 | RC Celta | - | Atlético Madrid | 0:1 |
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