| 1. Round | 01/08/1999 | Baník Ostrava | - | Chmel Blsany | 6:1 | ||||
| 2. Round | 08/08/1999 | Slavia Praha | - | Baník Ostrava | 2:0 | ||||
| 3. Round | 15/08/1999 | Baník Ostrava | - | Sigma Olomouc | 2:2 | ||||
| 4. Round | 22/08/1999 | FC Petra Drnovice | - | Baník Ostrava | 1:0 | ||||
| 5. Round | 28/08/1999 | Baník Ostrava | - | Viktoria Žižkov | 1:1 | ||||
| 11. Round | 22/10/1999 | Baník Ostrava | - | FC Boby-sport Brno | 1:0 |  |
|||
| 12. Round | 31/10/1999 | CU Bohemians Praha | - | Baník Ostrava | 0:0 | ||||
| 13. Round | 07/11/1999 | Baník Ostrava | - | FC Dukla Pribram | 2:0 | ||||
| 14. Round | 20/11/1999 | Baník Ostrava | - | SK Hradec Králové | 2:2 | ||||
| 15. Round | 28/11/1999 | Slovan Liberec | - | Baník Ostrava | 1:0 | ||||
| 16. Round | 05/12/1999 | Chmel Blsany | - | Baník Ostrava | 1:0 |
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