| 1. Round | 07/08/2005 | FK Mladá Boleslav | - | Slovan Liberec | 2:4 | ||||
| 3. Round | 21/08/2005 | FK Mladá Boleslav | - | Chmel Blsany | 4:1 |  |
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| 4. Round | 27/08/2005 | Baník Ostrava | - | FK Mladá Boleslav | 1:3 | ||||
| 2. Round | 01/09/2005 | 1. FC Slovácko | - | FK Mladá Boleslav | 1:1 | ||||
| 5. Round | 11/09/2005 | FK Mladá Boleslav | - | FK Teplice | 0:2 | ||||
| 6. Round | 18/09/2005 | Sigma Olomouc | - | FK Mladá Boleslav | 2:3 | |
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| 7. Round | 25/09/2005 | FK Mladá Boleslav | - | FK Jablonec 97 | 2:1 | |
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| 8. Round | 03/10/2005 | Slavia Praha | - | FK Mladá Boleslav | 2:1 | ||||
| 9. Round | 16/10/2005 | FK Mladá Boleslav | - | Viktoria Plzeň | 2:2 | |
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| 10. Round | 22/10/2005 | Tescoma Zlín | - | FK Mladá Boleslav | 2:0 | ||||
| 11. Round | 30/10/2005 | FK Mladá Boleslav | - | FK Marila Příbram | 0:0 | ||||
| 12. Round | 06/11/2005 | FK Mladá Boleslav | - | FK SIAD Most | 1:0 |
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