| 2. Round | 09/07/2016 | Yokohama F. Marinos | - | Avispa Fukuoka | 3:0 | ||||
| 4. Round | 17/07/2016 | Sanfrecce Hiroshima | - | Yokohama F. Marinos | 2:2 | ||||
| 9. Round | 20/08/2016 | FC Tokyo | - | Yokohama F. Marinos | 1:0 | ||||
| 10. Round | 27/08/2016 | Yokohama F. Marinos | - | Kashima Antlers | 2:2 | ||||
| 11. Round | 10/09/2016 | Vegalta Sendai | - | Yokohama F. Marinos | 0:1 |  |
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| 12. Round | 17/09/2016 | Yokohama F. Marinos | - | Albirex Niigata | 3:1 | |
|||
| 13. Round | 25/09/2016 | Kawasaki Frontale | - | Yokohama F. Marinos | 3:2 | ||||
| 16. Round | 29/10/2016 | Sagan Tosu | - | Yokohama F. Marinos | 2:2 | ||||
| 17. Round | 03/11/2016 | Urawa Red Diamonds | - | Yokohama F. Marinos | 1:1 |
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