| 21. Round | 05/04/2025 | Zbrojovka Brno | - | MFK Vyškov | 1:2 | ||||
| 26. Round | 04/05/2025 | Sigma Olomouc B | - | MFK Vyškov | 0:4 | ||||
| 27. Round | 07/05/2025 | MFK Vyškov | - | SK Líšeň | 0:1 | ||||
| 28. Round | 11/05/2025 | FC Zlín | - | MFK Vyškov | 2:1 | ||||
| 29. Round | 17/05/2025 | MFK Vyškov | - | Viktoria Žižkov | 2:0 | ||||
| 30. Round | 25/05/2025 | 1. SK Prostějov | - | MFK Vyškov | 0:2 |
Japan