| 11. Round | 27/11/2011 | Panathinaikos | - | OFI Heraklion | 3:1 | ||||
| 12. Round | 03/12/2011 | OFI Heraklion | - | Asteras Tripolis | 3:0 | ||||
| 2. Round | 07/12/2011 | Doxa Dramas FC | - | OFI Heraklion | 0:1 | ||||
| 15. Round | 03/01/2012 | PAS Giannina | - | OFI Heraklion | 0:0 | ||||
| 16. Round | 08/01/2012 | Atromitos | - | OFI Heraklion | 2:0 | ||||
| 17. Round | 14/01/2012 | OFI Heraklion | - | Doxa Dramas FC | 2:0 | ||||
| 19. Round | 28/01/2012 | OFI Heraklion | - | Skoda Xanthi | 1:0 | ||||
| 20. Round | 04/02/2012 | Ergotelis | - | OFI Heraklion | 0:1 | ||||
| 21. Round | 11/02/2012 | OFI Heraklion | - | PAOK Saloniki | 0:2 | ||||
| 22. Round | 26/02/2012 | AEK Athen | - | OFI Heraklion | 1:1 | ||||
| 25. Round | 17/03/2012 | Aris Saloniki | - | OFI Heraklion | 1:0 |  |
|||
| 26. Round | 24/03/2012 | OFI Heraklion | - | Panathinaikos | 0:1 | |
|||
| 27. Round | 01/04/2012 | Asteras Tripolis | - | OFI Heraklion | 2:2 | ||||
| 29. Round | 18/04/2012 | AO Kerkyra | - | OFI Heraklion | 4:1 |
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