| 3. Round | 13/07/2016 | Yokohama F. Marinos | - | Vissel Kobe | 3:2 | ||||
| 4. Round | 17/07/2016 | Vissel Kobe | - | Shonan Bellmare | 2:0 | ||||
| 5. Round | 23/07/2016 | Sanfrecce Hiroshima | - | Vissel Kobe | 2:0 | ||||
| 6. Round | 30/07/2016 | Vissel Kobe | - | RB Omiya Ardija | 1:0 | ||||
| 7. Round | 06/08/2016 | Albirex Niigata | - | Vissel Kobe | 1:0 | ||||
| 8. Round | 13/08/2016 | Vissel Kobe | - | FC Tokyo | 4:1 | ||||
| 9. Round | 20/08/2016 | Gamba Osaka | - | Vissel Kobe | 0:1 | ||||
| 11. Round | 10/09/2016 | Júbilo Iwata | - | Vissel Kobe | 3:4 | ||||
| 12. Round | 17/09/2016 | Vissel Kobe | - | Kashiwa Reysol | 1:1 | ||||
| 13. Round | 25/09/2016 | Avispa Fukuoka | - | Vissel Kobe | 1:4 | ||||
| 14. Round | 01/10/2016 | Vissel Kobe | - | Kawasaki Frontale | 3:0 |  |
|||
| 15. Round | 22/10/2016 | Vegalta Sendai | - | Vissel Kobe | 3:0 | ||||
| 16. Round | 29/10/2016 | Vissel Kobe | - | Nagoya Grampus | 3:0 | ||||
| 17. Round | 03/11/2016 | Kashima Antlers | - | Vissel Kobe | 0:1 |
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