| 1. Round | 23/06/2000 | FC Tokyo | - | Yokohama F. Marinos | 3:0 |  |
|||
| 2. Round | 30/06/2000 | Yokohama F. Marinos | - | Shimizu S-Pulse | 0:1 | ||||
| 4. Round | 14/07/2000 | Yokohama F. Marinos | - | Sanfrecce Hiroshima | 4:2 | ||||
| 5. Round | 21/07/2000 | Gamba Osaka | - | Yokohama F. Marinos | 2:1 | ||||
| 6. Round | 25/07/2000 | Yokohama F. Marinos | - | Kashiwa Reysol | 1:0 | ||||
| 7. Round | 28/07/2000 | Nagoya Grampus Eight | - | Yokohama F. Marinos | 3:2 | ||||
| 8. Round | 04/08/2000 | Yokohama F. Marinos | - | Kashima Antlers | 1:1 aet | ||||
| 9. Round | 11/08/2000 | Júbilo Iwata | - | Yokohama F. Marinos | 4:0 | ||||
| 10. Round | 18/08/2000 | Yokohama F. Marinos | - | Verdy Kawasaki | 3:2 | ||||
| 11. Round | 07/11/2000 | Vissel Kobe | - | Yokohama F. Marinos | 2:4 | ||||
| 12. Round | 10/11/2000 | Yokohama F. Marinos | - | JEF United Ichihara | 1:0 | |
|||
| 13. Round | 17/11/2000 | Cerezo Osaka | - | Yokohama F. Marinos | 1:2 | ||||
| 14. Round | 22/11/2000 | Kawasaki Frontale | - | Yokohama F. Marinos | 1:0 aet | ||||
| 15. Round | 25/11/2000 | Yokohama F. Marinos | - | Avispa Fukuoka | 2:1 aet |
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