| 1. Round | 07/03/2009 | Júbilo Iwata | - | Montedio Yamagata | 2:6 | ||||
| 2. Round | 14/03/2009 | Gamba Osaka | - | Júbilo Iwata | 4:1 | ||||
| 3. Round | 21/03/2009 | Júbilo Iwata | - | Urawa Red Diamonds | 1:1 | ||||
| 5. Round | 11/04/2009 | JEF United Chiba | - | Júbilo Iwata | 1:1 | ||||
| 6. Round | 19/04/2009 | Júbilo Iwata | - | Shimizu S-Pulse | 3:0 | ||||
| 7. Round | 25/04/2009 | Kyoto Sanga FC | - | Júbilo Iwata | 2:3 | ||||
| 9. Round | 02/05/2009 | Júbilo Iwata | - | Vissel Kobe | 1:0 | ||||
| 10. Round | 05/05/2009 | Albirex Niigata | - | Júbilo Iwata | 3:3 | ||||
| 11. Round | 09/05/2009 | Júbilo Iwata | - | RB Omiya Ardija | 3:1 | ||||
| 12. Round | 16/05/2009 | Kawasaki Frontale | - | Júbilo Iwata | 2:0 | ||||
| 14. Round | 20/06/2009 | Kashima Antlers | - | Júbilo Iwata | 1:0 | ||||
| 15. Round | 27/06/2009 | Júbilo Iwata | - | Kashiwa Reysol | 2:3 | ||||
| 27. Round | 26/09/2009 | FC Tokyo | - | Júbilo Iwata | 3:2 | ||||
| 29. Round | 17/10/2009 | Júbilo Iwata | - | Kashima Antlers | 0:0 |  |
|||
| 30. Round | 25/10/2009 | Nagoya Grampus | - | Júbilo Iwata | 3:3 |
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