| 3. Round | 12/03/2016 | Albirex Niigata | - | Yokohama F. Marinos | 1:2 |  |
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| 10. Round | 04/05/2016 | Nagoya Grampus | - | Yokohama F. Marinos | 3:1 | ||||
| 11. Round | 08/05/2016 | Yokohama F. Marinos | - | Ventforet Kofu | 2:2 | ||||
| 12. Round | 14/05/2016 | Kashima Antlers | - | Yokohama F. Marinos | 1:0 | ||||
| 13. Round | 21/05/2016 | Vissel Kobe | - | Yokohama F. Marinos | 0:1 |  |
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| 14. Round | 29/05/2016 | Yokohama F. Marinos | - | Kashiwa Reysol | 3:0 | |
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| 15. Round | 11/06/2016 | Yokohama F. Marinos | - | Kawasaki Frontale | 0:2 |
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